氣候炎熱、病菌活躍，書田診所家醫科主任何一成指出，夏天容易細菌滋生，家裡的肉類、蔬果等食材和吃剩的食物保存不當，都容易引發腹瀉

致病微生物污染，致病性微生物污染食品後急劇繁殖，致使食品中存有大量活菌（如沙門氏菌，Salmonella）或產生大量毒素（如金黃色葡萄菌，Staphylococcus aureus，產生的腸毒素enterotoxin）。

有毒化學物質污染，食品中混入有毒化學物質，並達到能引起急性中毒的劑量。如農藥的污染。 食品原料本身的有毒物質，食品本身含有毒成分（如河豚含有河豚毒素），而加工、烹調方法不當，未能將有毒物質除盡。

儲存過程中產生的毒素，食品在貯存過程中，由於貯藏條件不當而產生了有毒物質（如馬鈴薯發芽產生龍葵素）。

物鏈或生物鏈毒素的轉移，因攝入含有毒素成分的某些食用動物（如食入毒藻的海水魚、貝；採用有毒蜜源植物釀的蜂蜜）、因為吸收了有毒物質的食用植物，這些動植物起著毒素的轉移與富集作用。

誤食，某些外形與食物相似，而實際含有毒成分的植物，被作為食物誤食而引起中毒（如毒蕈等）。

食品的原材料問題：如使用未經檢疫的病死家畜肉加工的肉製品，使用攙假的牛乳加工的奶粉；如消毒不嚴，使用未經消毒的牛乳生產的雪糕；使用非食品原料如工業酒精（或甲醇）兌制的「配製酒」造成的甲醇中毒，也曾多次發生；使

用不符合食品衛生要求的食品添加劑或加工助劑（含砷等毒物質）也曾造成食物中毒；生產工藝、設備、容器和包裝材料不符合衛生要求也可使食品污染帶有毒性，例如，熟肉製品加工製作時，生熟不分交叉污染而引起食物中毒；採用生棉子榨油，毛油又未經鹼煉，而引起棉酚中毒；生產蒸餾酒時，使用含鉛蒸餾設備和貯酒容器，鉛溶於酒中而造成鉛中毒。

食品與包裝問題，日本曾發生桔子汁罐頭中溶錫過多而引起食物中毒，其原因是調汁用水中含硝酸根離子較多所致

。美國曾發生的金槍魚罐頭引起的E型肉毒梭菌食物中毒是由於罐頭殺菌冷卻時帶有病原菌的不潔冷卻水侵入罐內造成，內容物二次污染所致。